赣州农校创办于1915年，于1981年复办；2005年成立赣州机电工程职业中专学校，与赣州农业学校、赣州农业干部学校三块牌子、一套人马合署办学。学校现由赣州职业技术学院管理，同时接受市教育局和市农业农村局业务指导。
学校目前和赣州职业技术学院、江西赣州技师学院三校同在一个校区内，占地面积800多亩，总投资11亿元，校园环境优美。学校教学设施齐全，教学资源丰富，建有省级计算机软件及应用实训基地、机械加工、电子电工、食品加工、服装设计、语音室等专业实训室62个，图书近30万册。
学校教职工人数共200人，教师队伍整体素质高，其中教授级讲师3人、高级讲师71人、“双师型”教师132人，现有在校生4974人。学校开设新能源汽车制造与检测、物联网技术应用、幼儿保育、宠物养护与经营、电气设备运行与控制（电梯方向）、畜禽生产技术、食品加工工艺、园艺技术、模具制造技术、计算机应用、会计事务、服装设计与工艺、客户信息服务等24个专业，其中园艺技术、畜禽生产技术、作物生产技术、计算机应用为国家示范校重点建设专业，园艺技术、畜禽生产技术为省重点建设专业，现代农业专业群为省中职学校特色专业群建设计划立项项目，园艺技术为市中职学校十大特色专业。
学校2005年被评为国家级重点中专；2015年被评为国家中等职业教育改革发展示范学校，为全省唯一的农业类国家级中职示范学校；2019年被列为“中国中职教育50强”，2020年获批建设江西省中等职业学校区域性职业教育产教融合公共实习实训基地项目。连续多年被评为社会治安综合治理目标管理（平安赣州建设）先进单位、全市公共机构节能工作考核优秀单位及赣州市文明校园。